工程中心建立了安全与环境保护制度，包括：安全防护管理制度，安全制度（四防措施）、消防安全责任制度、安全检查制度、特殊实验相关安全管理措施、特殊试剂管理办法、特殊试剂领用发放记录、特殊试剂购入记录、紧急情况处理预案、处理应急情况指南、固体废弃物及废水、废气管理制度等。